バックアップを復元すると、完全に元の状態になるの? - いまさら聞けないiPhoneのなぜ

引き継がれないデータは、iPhoneのハードウェア固有情報と関係があるものです。たとえば、Touch IDの指紋データは、ハードウェアと結びついた特に秘匿性が高い情報として扱われていますから、バックアップの対象には含まれません。Bluetoothのペアリングも特定のハードウェア間で行われるため、バックアップを復元したところで元どおりにはなりません。

アプリが動作するかどうかについても、保証されるわけではありません。バックアップ作成元では問題なかったアプリが復元先では正常動作しなかった、という事態はありえます。復元したアプリが動作するかどうかは、そのアプリの開発元の対応次第となります。

とはいえ、メールボックスの内容や電話の着信履歴が残り、Wi-Fiアクセスポイントを再設定する必要がなく、アプリの設定まで引き継がれるパソコンへの(暗号化)バックアップは、iPhoneの機種変更時におけるベストの方法です。指紋の登録やBluetooth機器のペアリングは諦めて、やり直しましょう。