ムロツヨシ、“無言の友”が家に「飲み仲間」「愚痴を聞いてくれる」

「またボス・ベイビーが皆さんの前に……新しい、大人から戻るボス・ベイビーが見られるので楽しんでいただきたい」とアピールした。

本作の舞台は、前作の25年後の世界。大人になったボス・ベイビーと兄ティムの元に、「悪の天才博士が世界征服を企んでいる」という情報をキャッチしたベイビー社から、ティムの次女ティナが「ボス・レディ」として派遣される。ボス・レディは、疎遠だった2人をスーパーミルクで赤ちゃん返りさせ、おなじみの兄弟2人組として潜入捜査に向かわせることに。見た目は赤ちゃん、中身は本当におっさんの2人が、史上最大のミッションに立ち向かう。